Le processus de compostage de la phase 2 se déroule dans un tunnel. Ici, le matériau est disposé en couches sur une hauteur d’environ huit pieds sur un sol de béton rainuré, qui permet l’aération dans toute la masse. C’est à ce stade que se produit la pasteurisation et que sont détruits tous les organismes indésirables. Pour ce faire, l’air et le substrat sont maintenus à une température de 138 °F pendant six à huit heures. Ensuite, la masse est progressivement refroidi, ce qui favorise la conversion (ou conditionnement) et maintenu pendant quatre à cinq jours à une température de 118 °F jusqu’à ce qu’elle soit prête pour l’étape suivante.